İstanbul'da Mühendislik mektebinde okumuştur. Darülfünun Ulumu Siyasiye ve Tıbbiye Şubesi Müdürlüğünde bulunmuştur. Agop Babikyan'ın ölümü üzerine, 23 Kasım 1909 tarihinde Meclis-i Mebûsan Tekirdağ mebusluğuna seçilmiştir. Boyacıyan, 1912 seçimlerinde de tekrar Tekirdağ mebusu seçilmeyi başarmıştır. Agop Boyacıyan 1908 yılında kurulan Türk Derneği'nin üyeleri arasında yer almıştır.